21 вересня 2006 року в Національній бібліотеці України імені В.І. Вернадського з метою гідного вшанування пам'яті видатного громадсько-політичного і державного діяча, науковця Сергія Єфремова відбулася наукова конференція "Сергій Єфремов – український учений і громадсько-політичний діяч та історія національного відродження" і розгорнуто книжково-інформаційну виставку "Сергій Єфремов – український учений і громадсько-політичний діяч (до 130-річчя від дня народження)". Заходи здійснюються згідно з Указом Президента України "Про вшанування пам'яті Сергія Єфремова" та Розпорядженням Президії НАН України.

25 квітня 2006 року в Національній бібліотеці України імені В.І. Вернадського відбулася наукова конференція "Національна академія наук України — Чорнобилю" та науково-просвітницька і культурологічна акція, присвячені 20-річчю Чорнобильської катастрофи. У заході взяли участь установи НАН України та інші організації, які брали участь у ліквідації наслідків аварії на ЧАЕС у 1986 р. і сьогодні працюють над проблемами її мінімінізації та питаннями поліпшення екологічної ситуації в країні.

11-12 жовтня 2005 р. у м. Києві Національною бібліотекою України імені В.І. Вернадського спільно з Асоціацією бібліотек України і Радою директорів наукових бібліотек та інформаційних центрів академій наук — членів Міжнародної асоціації академій наук було проведено міжнародну наукову конференцію "Інтелектуальні технології у бібліотечній справі".

24 травня 2005 року в Національній бібліотеці України імені В.І.Вернадського відбулася Міжнародна наукова конференція "Проблеми етносоціального та етнокультурного розвитку Київської Русі та слов'янський світ", присвячена Дню слов'янської писемності та культури.